Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc5P32043 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc5P32043 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc5P32043 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc5P32043 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc5P32043 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc5P32043 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc5P32043 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc5P32043 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hoxc5P32043 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc5P32043 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc5P32043 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc5P32043 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc5P32043 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc5P32043 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc5P32043 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc5P32043 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc5P32043 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc5P32043 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc5P32043 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc5P32043 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc5P32043 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc5P32043 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc5P32043 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc5P32043 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc5P32043 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc5P32043 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc5P32043 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc5P32043 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc5P32043 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc5P32043 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc5P32043 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc5P32043 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc5P32043 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc5P32043 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc5P32043 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc5P32043 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc5P32043 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc5P32043 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc5P32043 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc5P32043 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc5P32043 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc5P32043 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc5P32043 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc5P32043 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc5P32043 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc5P32043 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc5P32043 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc5P32043 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc5P32043 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc5P32043 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc5P32043 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxc5P32043 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc5P32043 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc5P32043 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc5P32043 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc5P32043 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc5P32043 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc5P32043 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc5P32043 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc5P32043 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc5P32043 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc5P32043 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc5P32043 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc5P32043 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc5P32043 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc5P32043 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc5P32043 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc5P32043 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc5P32043 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc5P32043 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc5P32043 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc5P32043 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc5P32043 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc5P32043 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc5P32043 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc5P32043 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc5P32043 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc5P32043 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc5P32043 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc5P32043 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.7 ms