Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gsx2P31316 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gsx2P31316 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gsx2P31316 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gsx2P31316 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gsx2P31316 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gsx2P31316 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gsx2P31316 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gsx2P31316 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gsx2P31316 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gsx2P31316 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gsx2P31316 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gsx2P31316 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gsx2P31316 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gsx2P31316 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gsx2P31316 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gsx2P31316 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gsx2P31316 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gsx2P31316 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gsx2P31316 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gsx2P31316 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gsx2P31316 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gsx2P31316 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gsx2P31316 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gsx2P31316 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gsx2P31316 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gsx2P31316 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gsx2P31316 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gsx2P31316 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gsx2P31316 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gsx2P31316 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gsx2P31316 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gsx2P31316 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gsx2P31316 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gsx2P31316 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gsx2P31316 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gsx2P31316 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gsx2P31316 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gsx2P31316 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gsx2P31316 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gsx2P31316 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gsx2P31316 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gsx2P31316 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gsx2P31316 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gsx2P31316 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gsx2P31316 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gsx2P31316 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gsx2P31316 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gsx2P31316 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gsx2P31316 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gsx2P31316 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gsx2P31316 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gsx2P31316 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gsx2P31316 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gsx2P31316 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gsx2P31316 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gsx2P31316 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gsx2P31316 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gsx2P31316 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gsx2P31316 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gsx2P31316 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gsx2P31316 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gsx2P31316 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gsx2P31316 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gsx2P31316 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gsx2P31316 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gsx2P31316 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gsx2P31316 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gsx2P31316 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gsx2P31316 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gsx2P31316 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gsx2P31316 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gsx2P31316 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gsx2P31316 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gsx2P31316 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gsx2P31316 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gsx2P31316 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gsx2P31316 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Gsx2P31316 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gsx2P31316 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gsx2P31316 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gsx2P31316 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gsx2P31316 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gsx2P31316 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gsx2P31316 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gsx2P31316 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gsx2P31316 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gsx2P31316 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gsx2P31316 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gsx2P31316 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gsx2P31316 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gsx2P31316 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gsx2P31316 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gsx2P31316 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gsx2P31316 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gsx2P31316 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gsx2P31316 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gsx2P31316 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gsx2P31316 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gsx2P31316 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms