Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc11P31313 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc11P31313 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc11P31313 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc11P31313 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc11P31313 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc11P31313 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc11P31313 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc11P31313 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc11P31313 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc11P31313 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc11P31313 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc11P31313 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc11P31313 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc11P31313 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc11P31313 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc11P31313 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxc11P31313 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxc11P31313 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc11P31313 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc11P31313 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc11P31313 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc11P31313 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc11P31313 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc11P31313 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc11P31313 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc11P31313 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc11P31313 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc11P31313 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc11P31313 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc11P31313 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc11P31313 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc11P31313 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc11P31313 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc11P31313 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc11P31313 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc11P31313 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc11P31313 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc11P31313 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc11P31313 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc11P31313 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc11P31313 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc11P31313 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxc11P31313 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc11P31313 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc11P31313 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc11P31313 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxc11P31313 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc11P31313 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc11P31313 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc11P31313 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc11P31313 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc11P31313 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc11P31313 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc11P31313 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxc11P31313 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc11P31313 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc11P31313 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc11P31313 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc11P31313 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc11P31313 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxc11P31313 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc11P31313 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc11P31313 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc11P31313 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc11P31313 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc11P31313 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc11P31313 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc11P31313 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc11P31313 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc11P31313 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc11P31313 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxc11P31313 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxc11P31313 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc11P31313 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc11P31313 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc11P31313 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc11P31313 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc11P31313 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc11P31313 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc11P31313 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc11P31313 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc11P31313 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc11P31313 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc11P31313 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc11P31313 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxc11P31313 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxc11P31313 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc11P31313 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc11P31313 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc11P31313 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc11P31313 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc11P31313 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc11P31313 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc11P31313 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc11P31313 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc11P31313 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc11P31313 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc11P31313 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc11P31313 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms