Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Cd28P31041 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Cd28P31041 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Cd28P31041 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,66■■□□□ 1,06
Cd28P31041 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Cd28P31041 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Cd28P31041 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Cd28P31041 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Cd28P31041 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21,64■■□□□ 1,05
Cd28P31041 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Cd28P31041 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Cd28P31041 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Cd28P31041 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Cd28P31041 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Cd28P31041 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Cd28P31041 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Cd28P31041 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Cd28P31041 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Cd28P31041 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Cd28P31041 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Cd28P31041 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21,57■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,55■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21,55■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21,54■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,54■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21,53■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Cd28P31041 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,51■■□□□ 1,03
Cd28P31041 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Cd28P31041 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21,51■■□□□ 1,03
Cd28P31041 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21,51■■□□□ 1,03
Cd28P31041 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Cd28P31041 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Cd28P31041 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21,48■■□□□ 1,03
Cd28P31041 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Cd28P31041 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Cd28P31041 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Cd28P31041 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Cd28P31041 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21,46■■□□□ 1,03
Cd28P31041 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Cd28P31041 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Cd28P31041 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Cd28P31041 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Cd28P31041 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Cd28P31041 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Cd28P31041 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Cd28P31041 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Cd28P31041 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Cd28P31041 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Cd28P31041 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Cd28P31041 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Cd28P31041 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21,4■■□□□ 1,02
Cd28P31041 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21,4■■□□□ 1,02
Cd28P31041 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Cd28P31041 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21,39■■□□□ 1,02
Cd28P31041 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
Cd28P31041 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Cd28P31041 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21,39■■□□□ 1,01
Cd28P31041 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21,39■■□□□ 1,01
Cd28P31041 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Cd28P31041 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21,37■■□□□ 1,01
Cd28P31041 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Cd28P31041 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Cd28P31041 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Cd28P31041 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Cd28P31041 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Cd28P31041 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Cd28P31041 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Cd28P31041 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Cd28P31041 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Cd28P31041 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Cd28P31041 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Cd28P31041 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Cd28P31041 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Cd28P31041 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,33■■□□□ 1,01
Cd28P31041 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Cd28P31041 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
Cd28P31041 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Cd28P31041 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Cd28P31041 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,32■■□□□ 1
Cd28P31041 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Cd28P31041 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Cd28P31041 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Cd28P31041 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,3■■□□□ 1
Cd28P31041 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,29■■□□□ 1
Cd28P31041 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
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