Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms