Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
RxraP28700 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
RxraP28700 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
RxraP28700 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
RxraP28700 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
RxraP28700 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
RxraP28700 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
RxraP28700 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
RxraP28700 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
RxraP28700 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24,64■■□□□ 1,54
RxraP28700 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,53
RxraP28700 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
RxraP28700 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
RxraP28700 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24,62■■□□□ 1,53
RxraP28700 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
RxraP28700 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
RxraP28700 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
RxraP28700 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
RxraP28700 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
RxraP28700 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,59■■□□□ 1,53
RxraP28700 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
RxraP28700 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
RxraP28700 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
RxraP28700 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
RxraP28700 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
RxraP28700 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
RxraP28700 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
RxraP28700 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
RxraP28700 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
RxraP28700 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
RxraP28700 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
RxraP28700 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
RxraP28700 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
RxraP28700 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
RxraP28700 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
RxraP28700 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24,55■■□□□ 1,52
RxraP28700 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
RxraP28700 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
RxraP28700 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24,54■■□□□ 1,52
RxraP28700 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,53■■□□□ 1,52
RxraP28700 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
RxraP28700 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
RxraP28700 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24,51■■□□□ 1,51
RxraP28700 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
RxraP28700 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
RxraP28700 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24,48■■□□□ 1,51
RxraP28700 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
RxraP28700 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
RxraP28700 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
RxraP28700 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
RxraP28700 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
RxraP28700 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
RxraP28700 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
RxraP28700 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
RxraP28700 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
RxraP28700 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
RxraP28700 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
RxraP28700 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,42■■□□□ 1,5
RxraP28700 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24,42■■□□□ 1,5
RxraP28700 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
RxraP28700 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
RxraP28700 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
RxraP28700 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24,4■■□□□ 1,5
RxraP28700 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
RxraP28700 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24,39■■□□□ 1,49
RxraP28700 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
RxraP28700 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
RxraP28700 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
RxraP28700 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
RxraP28700 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
RxraP28700 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
RxraP28700 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
RxraP28700 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
RxraP28700 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24,34■■□□□ 1,49
RxraP28700 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,33■■□□□ 1,49
RxraP28700 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
RxraP28700 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,32■■□□□ 1,48
RxraP28700 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24,31■■□□□ 1,48
RxraP28700 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24,31■■□□□ 1,48
RxraP28700 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,31■■□□□ 1,48
RxraP28700 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,3■■□□□ 1,48
RxraP28700 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
RxraP28700 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
RxraP28700 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24,29■■□□□ 1,48
RxraP28700 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
RxraP28700 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
RxraP28700 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
RxraP28700 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
RxraP28700 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
RxraP28700 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
RxraP28700 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24,28■■□□□ 1,48
RxraP28700 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
RxraP28700 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
RxraP28700 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24,27■■□□□ 1,48
RxraP28700 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
RxraP28700 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
RxraP28700 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24,26■■□□□ 1,47
RxraP28700 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
RxraP28700 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
RxraP28700 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms