Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apex1P28352 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apex1P28352 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apex1P28352 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apex1P28352 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apex1P28352 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apex1P28352 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apex1P28352 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apex1P28352 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apex1P28352 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apex1P28352 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apex1P28352 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apex1P28352 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apex1P28352 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Apex1P28352 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apex1P28352 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apex1P28352 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apex1P28352 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apex1P28352 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apex1P28352 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apex1P28352 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apex1P28352 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apex1P28352 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apex1P28352 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apex1P28352 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apex1P28352 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apex1P28352 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apex1P28352 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apex1P28352 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apex1P28352 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apex1P28352 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apex1P28352 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apex1P28352 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apex1P28352 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apex1P28352 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apex1P28352 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Apex1P28352 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apex1P28352 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apex1P28352 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apex1P28352 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apex1P28352 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apex1P28352 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apex1P28352 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apex1P28352 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apex1P28352 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apex1P28352 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apex1P28352 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apex1P28352 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apex1P28352 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apex1P28352 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apex1P28352 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apex1P28352 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apex1P28352 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apex1P28352 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apex1P28352 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apex1P28352 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apex1P28352 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apex1P28352 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apex1P28352 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apex1P28352 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apex1P28352 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apex1P28352 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apex1P28352 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Apex1P28352 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apex1P28352 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apex1P28352 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apex1P28352 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apex1P28352 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apex1P28352 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apex1P28352 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apex1P28352 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Apex1P28352 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apex1P28352 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apex1P28352 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apex1P28352 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apex1P28352 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apex1P28352 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apex1P28352 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apex1P28352 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apex1P28352 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apex1P28352 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apex1P28352 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apex1P28352 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apex1P28352 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apex1P28352 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Apex1P28352 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apex1P28352 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apex1P28352 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apex1P28352 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apex1P28352 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apex1P28352 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Apex1P28352 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apex1P28352 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apex1P28352 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Apex1P28352 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apex1P28352 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apex1P28352 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apex1P28352 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apex1P28352 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apex1P28352 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms