Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pde6aP27664 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pde6aP27664 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pde6aP27664 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pde6aP27664 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pde6aP27664 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pde6aP27664 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pde6aP27664 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pde6aP27664 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Pde6aP27664 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pde6aP27664 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pde6aP27664 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pde6aP27664 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pde6aP27664 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pde6aP27664 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pde6aP27664 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pde6aP27664 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pde6aP27664 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pde6aP27664 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pde6aP27664 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pde6aP27664 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pde6aP27664 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pde6aP27664 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Pde6aP27664 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pde6aP27664 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Pde6aP27664 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pde6aP27664 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pde6aP27664 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pde6aP27664 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pde6aP27664 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Pde6aP27664 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Pde6aP27664 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pde6aP27664 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Pde6aP27664 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pde6aP27664 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pde6aP27664 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pde6aP27664 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pde6aP27664 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pde6aP27664 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pde6aP27664 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Pde6aP27664 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pde6aP27664 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pde6aP27664 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pde6aP27664 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pde6aP27664 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pde6aP27664 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pde6aP27664 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pde6aP27664 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pde6aP27664 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pde6aP27664 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pde6aP27664 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pde6aP27664 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pde6aP27664 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pde6aP27664 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pde6aP27664 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pde6aP27664 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pde6aP27664 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pde6aP27664 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pde6aP27664 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pde6aP27664 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pde6aP27664 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pde6aP27664 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pde6aP27664 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pde6aP27664 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pde6aP27664 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pde6aP27664 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pde6aP27664 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pde6aP27664 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Pde6aP27664 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pde6aP27664 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pde6aP27664 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pde6aP27664 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pde6aP27664 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pde6aP27664 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pde6aP27664 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pde6aP27664 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pde6aP27664 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pde6aP27664 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pde6aP27664 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pde6aP27664 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pde6aP27664 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pde6aP27664 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pde6aP27664 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pde6aP27664 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pde6aP27664 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pde6aP27664 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pde6aP27664 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pde6aP27664 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pde6aP27664 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pde6aP27664 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pde6aP27664 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pde6aP27664 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Pde6aP27664 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pde6aP27664 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pde6aP27664 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pde6aP27664 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pde6aP27664 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde6aP27664 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde6aP27664 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde6aP27664 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms