Protein–RNA interactions for Protein: P26638

Sars, Serine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarsP26638 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SarsP26638 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SarsP26638 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SarsP26638 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SarsP26638 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SarsP26638 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SarsP26638 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SarsP26638 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SarsP26638 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SarsP26638 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SarsP26638 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SarsP26638 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SarsP26638 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SarsP26638 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SarsP26638 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SarsP26638 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SarsP26638 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SarsP26638 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SarsP26638 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SarsP26638 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SarsP26638 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SarsP26638 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SarsP26638 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SarsP26638 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SarsP26638 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SarsP26638 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SarsP26638 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SarsP26638 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SarsP26638 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SarsP26638 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SarsP26638 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SarsP26638 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SarsP26638 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SarsP26638 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SarsP26638 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SarsP26638 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SarsP26638 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SarsP26638 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SarsP26638 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SarsP26638 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SarsP26638 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SarsP26638 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SarsP26638 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SarsP26638 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SarsP26638 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SarsP26638 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SarsP26638 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SarsP26638 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SarsP26638 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SarsP26638 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SarsP26638 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SarsP26638 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SarsP26638 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SarsP26638 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SarsP26638 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SarsP26638 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SarsP26638 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SarsP26638 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SarsP26638 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SarsP26638 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SarsP26638 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SarsP26638 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SarsP26638 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SarsP26638 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SarsP26638 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SarsP26638 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SarsP26638 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SarsP26638 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SarsP26638 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SarsP26638 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SarsP26638 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SarsP26638 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SarsP26638 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SarsP26638 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SarsP26638 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SarsP26638 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SarsP26638 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SarsP26638 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SarsP26638 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SarsP26638 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SarsP26638 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SarsP26638 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SarsP26638 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SarsP26638 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SarsP26638 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SarsP26638 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SarsP26638 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SarsP26638 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SarsP26638 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SarsP26638 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SarsP26638 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SarsP26638 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SarsP26638 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SarsP26638 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SarsP26638 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SarsP26638 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SarsP26638 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SarsP26638 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SarsP26638 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SarsP26638 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms