Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
UbtfP25976 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
UbtfP25976 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
UbtfP25976 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
UbtfP25976 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
UbtfP25976 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
UbtfP25976 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
UbtfP25976 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
UbtfP25976 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
UbtfP25976 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
UbtfP25976 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
UbtfP25976 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
UbtfP25976 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
UbtfP25976 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
UbtfP25976 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
UbtfP25976 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
UbtfP25976 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
UbtfP25976 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
UbtfP25976 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
UbtfP25976 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
UbtfP25976 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
UbtfP25976 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
UbtfP25976 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
UbtfP25976 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
UbtfP25976 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
UbtfP25976 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
UbtfP25976 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
UbtfP25976 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
UbtfP25976 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
UbtfP25976 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
UbtfP25976 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
UbtfP25976 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
UbtfP25976 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
UbtfP25976 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
UbtfP25976 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
UbtfP25976 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
UbtfP25976 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
UbtfP25976 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
UbtfP25976 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
UbtfP25976 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
UbtfP25976 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
UbtfP25976 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
UbtfP25976 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
UbtfP25976 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
UbtfP25976 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
UbtfP25976 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
UbtfP25976 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
UbtfP25976 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
UbtfP25976 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
UbtfP25976 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
UbtfP25976 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
UbtfP25976 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
UbtfP25976 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
UbtfP25976 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
UbtfP25976 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
UbtfP25976 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
UbtfP25976 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
UbtfP25976 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
UbtfP25976 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
UbtfP25976 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
UbtfP25976 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
UbtfP25976 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
UbtfP25976 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
UbtfP25976 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
UbtfP25976 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
UbtfP25976 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
UbtfP25976 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
UbtfP25976 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
UbtfP25976 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
UbtfP25976 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
UbtfP25976 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
UbtfP25976 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
UbtfP25976 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
UbtfP25976 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
UbtfP25976 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
UbtfP25976 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
UbtfP25976 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
UbtfP25976 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
UbtfP25976 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
UbtfP25976 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
UbtfP25976 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
UbtfP25976 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
UbtfP25976 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
UbtfP25976 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
UbtfP25976 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
UbtfP25976 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
UbtfP25976 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
UbtfP25976 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
UbtfP25976 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
UbtfP25976 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
UbtfP25976 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
UbtfP25976 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
UbtfP25976 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
UbtfP25976 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
UbtfP25976 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
UbtfP25976 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
UbtfP25976 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
UbtfP25976 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
UbtfP25976 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
UbtfP25976 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.6 ms