Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Mdm2P23804 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Mdm2P23804 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Mdm2P23804 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Mdm2P23804 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Mdm2P23804 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Mdm2P23804 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Mdm2P23804 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,86■■■□□ 2,37
Mdm2P23804 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Mdm2P23804 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Mdm2P23804 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Mdm2P23804 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
Mdm2P23804 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Mdm2P23804 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Mdm2P23804 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Mdm2P23804 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Mdm2P23804 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Mdm2P23804 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Mdm2P23804 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Mdm2P23804 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Mdm2P23804 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Mdm2P23804 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Mdm2P23804 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Mdm2P23804 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,76■■■□□ 2,35
Mdm2P23804 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Mdm2P23804 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,76■■■□□ 2,35
Mdm2P23804 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Mdm2P23804 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Mdm2P23804 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Mdm2P23804 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Mdm2P23804 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Mdm2P23804 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Mdm2P23804 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Mdm2P23804 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Mdm2P23804 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Mdm2P23804 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Mdm2P23804 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Mdm2P23804 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Mdm2P23804 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Mdm2P23804 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Mdm2P23804 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Mdm2P23804 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Mdm2P23804 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Mdm2P23804 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Mdm2P23804 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Mdm2P23804 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Mdm2P23804 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Mdm2P23804 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Mdm2P23804 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Mdm2P23804 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Mdm2P23804 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Mdm2P23804 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Mdm2P23804 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Mdm2P23804 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Mdm2P23804 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Mdm2P23804 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Mdm2P23804 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Mdm2P23804 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Mdm2P23804 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Mdm2P23804 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Mdm2P23804 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Mdm2P23804 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Mdm2P23804 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Mdm2P23804 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Mdm2P23804 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Mdm2P23804 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Mdm2P23804 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Mdm2P23804 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Mdm2P23804 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Mdm2P23804 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Mdm2P23804 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Mdm2P23804 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Mdm2P23804 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Mdm2P23804 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Mdm2P23804 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Mdm2P23804 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Mdm2P23804 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Mdm2P23804 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Mdm2P23804 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Mdm2P23804 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29,49■■■□□ 2,31
Mdm2P23804 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Mdm2P23804 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Mdm2P23804 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Mdm2P23804 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29,47■■■□□ 2,31
Mdm2P23804 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Mdm2P23804 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Mdm2P23804 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Mdm2P23804 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Mdm2P23804 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Mdm2P23804 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Mdm2P23804 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Mdm2P23804 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Mdm2P23804 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Mdm2P23804 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Mdm2P23804 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Mdm2P23804 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Mdm2P23804 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Mdm2P23804 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Mdm2P23804 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Mdm2P23804 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms