Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb1aP21447 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb1aP21447 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcb1aP21447 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcb1aP21447 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcb1aP21447 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcb1aP21447 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcb1aP21447 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcb1aP21447 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcb1aP21447 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcb1aP21447 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcb1aP21447 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcb1aP21447 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcb1aP21447 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcb1aP21447 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb1aP21447 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb1aP21447 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb1aP21447 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb1aP21447 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcb1aP21447 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcb1aP21447 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcb1aP21447 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcb1aP21447 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcb1aP21447 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcb1aP21447 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcb1aP21447 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb1aP21447 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb1aP21447 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb1aP21447 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb1aP21447 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb1aP21447 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb1aP21447 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb1aP21447 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb1aP21447 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb1aP21447 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb1aP21447 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb1aP21447 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb1aP21447 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb1aP21447 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb1aP21447 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb1aP21447 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb1aP21447 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb1aP21447 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb1aP21447 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb1aP21447 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb1aP21447 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb1aP21447 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb1aP21447 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb1aP21447 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb1aP21447 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb1aP21447 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb1aP21447 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb1aP21447 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcb1aP21447 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcb1aP21447 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb1aP21447 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb1aP21447 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb1aP21447 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb1aP21447 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb1aP21447 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb1aP21447 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb1aP21447 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb1aP21447 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb1aP21447 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb1aP21447 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcb1aP21447 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcb1aP21447 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcb1aP21447 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcb1aP21447 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcb1aP21447 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb1aP21447 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb1aP21447 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb1aP21447 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb1aP21447 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb1aP21447 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb1aP21447 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb1aP21447 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb1aP21447 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb1aP21447 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb1aP21447 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb1aP21447 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb1aP21447 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb1aP21447 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb1aP21447 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb1aP21447 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb1aP21447 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb1aP21447 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb1aP21447 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb1aP21447 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb1aP21447 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb1aP21447 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb1aP21447 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb1aP21447 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb1aP21447 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb1aP21447 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb1aP21447 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb1aP21447 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb1aP21447 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb1aP21447 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms