Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ms4a2P20490 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ms4a2P20490 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ms4a2P20490 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ms4a2P20490 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ms4a2P20490 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ms4a2P20490 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ms4a2P20490 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ms4a2P20490 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ms4a2P20490 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ms4a2P20490 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ms4a2P20490 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ms4a2P20490 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ms4a2P20490 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ms4a2P20490 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ms4a2P20490 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ms4a2P20490 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ms4a2P20490 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ms4a2P20490 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ms4a2P20490 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ms4a2P20490 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ms4a2P20490 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ms4a2P20490 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ms4a2P20490 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ms4a2P20490 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ms4a2P20490 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ms4a2P20490 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ms4a2P20490 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ms4a2P20490 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ms4a2P20490 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ms4a2P20490 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ms4a2P20490 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ms4a2P20490 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ms4a2P20490 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ms4a2P20490 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ms4a2P20490 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ms4a2P20490 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ms4a2P20490 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ms4a2P20490 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ms4a2P20490 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ms4a2P20490 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ms4a2P20490 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ms4a2P20490 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ms4a2P20490 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ms4a2P20490 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ms4a2P20490 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ms4a2P20490 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ms4a2P20490 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ms4a2P20490 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ms4a2P20490 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ms4a2P20490 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ms4a2P20490 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ms4a2P20490 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ms4a2P20490 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ms4a2P20490 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ms4a2P20490 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Ms4a2P20490 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ms4a2P20490 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ms4a2P20490 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ms4a2P20490 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ms4a2P20490 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ms4a2P20490 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ms4a2P20490 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ms4a2P20490 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ms4a2P20490 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ms4a2P20490 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ms4a2P20490 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ms4a2P20490 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ms4a2P20490 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ms4a2P20490 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ms4a2P20490 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ms4a2P20490 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ms4a2P20490 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ms4a2P20490 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ms4a2P20490 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ms4a2P20490 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ms4a2P20490 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ms4a2P20490 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ms4a2P20490 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ms4a2P20490 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ms4a2P20490 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ms4a2P20490 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ms4a2P20490 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ms4a2P20490 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ms4a2P20490 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ms4a2P20490 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ms4a2P20490 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ms4a2P20490 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ms4a2P20490 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ms4a2P20490 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ms4a2P20490 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ms4a2P20490 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ms4a2P20490 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ms4a2P20490 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ms4a2P20490 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ms4a2P20490 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ms4a2P20490 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ms4a2P20490 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ms4a2P20490 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ms4a2P20490 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms