Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rag1P15919 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rag1P15919 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rag1P15919 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rag1P15919 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rag1P15919 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rag1P15919 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rag1P15919 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rag1P15919 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rag1P15919 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rag1P15919 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rag1P15919 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rag1P15919 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rag1P15919 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rag1P15919 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rag1P15919 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rag1P15919 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rag1P15919 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rag1P15919 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rag1P15919 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rag1P15919 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rag1P15919 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rag1P15919 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rag1P15919 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rag1P15919 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rag1P15919 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rag1P15919 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rag1P15919 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rag1P15919 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rag1P15919 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rag1P15919 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rag1P15919 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rag1P15919 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rag1P15919 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rag1P15919 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rag1P15919 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rag1P15919 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rag1P15919 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rag1P15919 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rag1P15919 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rag1P15919 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rag1P15919 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rag1P15919 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rag1P15919 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rag1P15919 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rag1P15919 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rag1P15919 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rag1P15919 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rag1P15919 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rag1P15919 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rag1P15919 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rag1P15919 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rag1P15919 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rag1P15919 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rag1P15919 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rag1P15919 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rag1P15919 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rag1P15919 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rag1P15919 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rag1P15919 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rag1P15919 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rag1P15919 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rag1P15919 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rag1P15919 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rag1P15919 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rag1P15919 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rag1P15919 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rag1P15919 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rag1P15919 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rag1P15919 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rag1P15919 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rag1P15919 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rag1P15919 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rag1P15919 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rag1P15919 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rag1P15919 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rag1P15919 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rag1P15919 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rag1P15919 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rag1P15919 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rag1P15919 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rag1P15919 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rag1P15919 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rag1P15919 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rag1P15919 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rag1P15919 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rag1P15919 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rag1P15919 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rag1P15919 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rag1P15919 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rag1P15919 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rag1P15919 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rag1P15919 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rag1P15919 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rag1P15919 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rag1P15919 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rag1P15919 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rag1P15919 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rag1P15919 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rag1P15919 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms