Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf271P15620 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf271P15620 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf271P15620 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf271P15620 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf271P15620 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf271P15620 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf271P15620 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf271P15620 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf271P15620 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf271P15620 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf271P15620 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf271P15620 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf271P15620 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf271P15620 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf271P15620 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf271P15620 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf271P15620 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf271P15620 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf271P15620 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf271P15620 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf271P15620 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf271P15620 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf271P15620 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf271P15620 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf271P15620 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf271P15620 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf271P15620 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf271P15620 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf271P15620 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf271P15620 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf271P15620 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf271P15620 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf271P15620 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf271P15620 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf271P15620 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf271P15620 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf271P15620 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf271P15620 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf271P15620 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf271P15620 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf271P15620 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf271P15620 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf271P15620 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf271P15620 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf271P15620 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf271P15620 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf271P15620 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf271P15620 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf271P15620 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf271P15620 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf271P15620 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf271P15620 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf271P15620 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf271P15620 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf271P15620 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf271P15620 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf271P15620 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf271P15620 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf271P15620 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf271P15620 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf271P15620 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf271P15620 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf271P15620 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf271P15620 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf271P15620 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf271P15620 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf271P15620 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf271P15620 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf271P15620 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf271P15620 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf271P15620 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf271P15620 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf271P15620 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf271P15620 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf271P15620 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf271P15620 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf271P15620 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf271P15620 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf271P15620 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf271P15620 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf271P15620 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf271P15620 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf271P15620 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf271P15620 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf271P15620 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf271P15620 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf271P15620 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf271P15620 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf271P15620 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf271P15620 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf271P15620 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf271P15620 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf271P15620 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf271P15620 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf271P15620 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf271P15620 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf271P15620 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf271P15620 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf271P15620 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms