Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrphP15331 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrphP15331 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrphP15331 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PrphP15331 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PrphP15331 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrphP15331 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrphP15331 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PrphP15331 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PrphP15331 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PrphP15331 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PrphP15331 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PrphP15331 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PrphP15331 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PrphP15331 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PrphP15331 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PrphP15331 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PrphP15331 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PrphP15331 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PrphP15331 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PrphP15331 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PrphP15331 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PrphP15331 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrphP15331 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrphP15331 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrphP15331 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PrphP15331 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PrphP15331 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PrphP15331 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PrphP15331 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrphP15331 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PrphP15331 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PrphP15331 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PrphP15331 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrphP15331 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrphP15331 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrphP15331 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrphP15331 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrphP15331 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrphP15331 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrphP15331 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrphP15331 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PrphP15331 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PrphP15331 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PrphP15331 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PrphP15331 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrphP15331 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrphP15331 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrphP15331 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PrphP15331 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PrphP15331 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrphP15331 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrphP15331 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrphP15331 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PrphP15331 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrphP15331 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrphP15331 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PrphP15331 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PrphP15331 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PrphP15331 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PrphP15331 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PrphP15331 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PrphP15331 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrphP15331 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrphP15331 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrphP15331 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PrphP15331 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrphP15331 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrphP15331 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrphP15331 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrphP15331 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrphP15331 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PrphP15331 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrphP15331 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrphP15331 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrphP15331 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrphP15331 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrphP15331 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrphP15331 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrphP15331 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrphP15331 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PrphP15331 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PrphP15331 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrphP15331 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrphP15331 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrphP15331 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrphP15331 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrphP15331 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrphP15331 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrphP15331 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrphP15331 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PrphP15331 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrphP15331 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PrphP15331 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PrphP15331 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrphP15331 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrphP15331 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrphP15331 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrphP15331 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrphP15331 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms