Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrphP15331 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrphP15331 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrphP15331 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PrphP15331 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PrphP15331 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrphP15331 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrphP15331 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PrphP15331 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PrphP15331 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PrphP15331 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PrphP15331 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PrphP15331 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PrphP15331 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PrphP15331 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PrphP15331 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PrphP15331 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PrphP15331 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PrphP15331 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PrphP15331 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PrphP15331 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PrphP15331 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PrphP15331 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrphP15331 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrphP15331 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PrphP15331 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PrphP15331 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PrphP15331 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PrphP15331 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PrphP15331 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrphP15331 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PrphP15331 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PrphP15331 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PrphP15331 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrphP15331 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrphP15331 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PrphP15331 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrphP15331 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrphP15331 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrphP15331 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrphP15331 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrphP15331 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PrphP15331 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PrphP15331 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PrphP15331 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PrphP15331 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrphP15331 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrphP15331 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrphP15331 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PrphP15331 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PrphP15331 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrphP15331 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrphP15331 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrphP15331 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PrphP15331 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrphP15331 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrphP15331 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PrphP15331 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PrphP15331 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PrphP15331 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PrphP15331 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PrphP15331 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PrphP15331 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrphP15331 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrphP15331 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrphP15331 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PrphP15331 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrphP15331 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrphP15331 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrphP15331 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrphP15331 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrphP15331 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PrphP15331 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrphP15331 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrphP15331 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PrphP15331 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrphP15331 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrphP15331 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrphP15331 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrphP15331 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrphP15331 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PrphP15331 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PrphP15331 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrphP15331 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrphP15331 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrphP15331 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrphP15331 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrphP15331 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrphP15331 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrphP15331 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrphP15331 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PrphP15331 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrphP15331 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PrphP15331 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PrphP15331 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrphP15331 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrphP15331 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrphP15331 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrphP15331 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrphP15331 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms