Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PolP11369 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PolP11369 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PolP11369 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PolP11369 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PolP11369 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PolP11369 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PolP11369 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PolP11369 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PolP11369 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PolP11369 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PolP11369 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PolP11369 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PolP11369 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PolP11369 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PolP11369 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PolP11369 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PolP11369 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PolP11369 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PolP11369 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PolP11369 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PolP11369 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PolP11369 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PolP11369 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PolP11369 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PolP11369 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PolP11369 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PolP11369 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PolP11369 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PolP11369 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PolP11369 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PolP11369 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PolP11369 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PolP11369 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PolP11369 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PolP11369 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PolP11369 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PolP11369 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PolP11369 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PolP11369 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PolP11369 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PolP11369 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PolP11369 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PolP11369 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PolP11369 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PolP11369 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PolP11369 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PolP11369 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PolP11369 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PolP11369 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PolP11369 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PolP11369 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PolP11369 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PolP11369 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PolP11369 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PolP11369 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PolP11369 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PolP11369 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PolP11369 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PolP11369 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PolP11369 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PolP11369 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PolP11369 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PolP11369 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PolP11369 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PolP11369 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PolP11369 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PolP11369 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PolP11369 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PolP11369 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PolP11369 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PolP11369 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PolP11369 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PolP11369 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PolP11369 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PolP11369 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PolP11369 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PolP11369 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PolP11369 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PolP11369 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PolP11369 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PolP11369 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PolP11369 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PolP11369 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PolP11369 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PolP11369 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PolP11369 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PolP11369 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PolP11369 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PolP11369 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PolP11369 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PolP11369 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PolP11369 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PolP11369 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PolP11369 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PolP11369 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PolP11369 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PolP11369 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PolP11369 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PolP11369 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms