Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Schip1P0DPB4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Schip1P0DPB4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Schip1P0DPB4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Schip1P0DPB4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Schip1P0DPB4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Schip1P0DPB4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Schip1P0DPB4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Schip1P0DPB4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Schip1P0DPB4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.8 ms