Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Amd1P0DMN7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Amd1P0DMN7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Amd1P0DMN7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Amd1P0DMN7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Amd1P0DMN7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Amd1P0DMN7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Amd1P0DMN7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Amd1P0DMN7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Amd1P0DMN7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Amd1P0DMN7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Amd1P0DMN7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Amd1P0DMN7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Amd1P0DMN7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Amd1P0DMN7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Amd1P0DMN7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Amd1P0DMN7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Amd1P0DMN7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Amd1P0DMN7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Amd1P0DMN7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Amd1P0DMN7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Amd1P0DMN7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Amd1P0DMN7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Amd1P0DMN7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Amd1P0DMN7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Amd1P0DMN7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Amd1P0DMN7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Amd1P0DMN7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Amd1P0DMN7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Amd1P0DMN7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Amd1P0DMN7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Amd1P0DMN7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Amd1P0DMN7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Amd1P0DMN7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Amd1P0DMN7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Amd1P0DMN7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Amd1P0DMN7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Amd1P0DMN7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Amd1P0DMN7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Amd1P0DMN7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Amd1P0DMN7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Amd1P0DMN7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Amd1P0DMN7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Amd1P0DMN7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Amd1P0DMN7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Amd1P0DMN7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Amd1P0DMN7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Amd1P0DMN7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Amd1P0DMN7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Amd1P0DMN7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Amd1P0DMN7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Amd1P0DMN7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Amd1P0DMN7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Amd1P0DMN7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Amd1P0DMN7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Amd1P0DMN7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Amd1P0DMN7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Amd1P0DMN7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Amd1P0DMN7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Amd1P0DMN7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Amd1P0DMN7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Amd1P0DMN7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Amd1P0DMN7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Amd1P0DMN7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Amd1P0DMN7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Amd1P0DMN7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Amd1P0DMN7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Amd1P0DMN7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Amd1P0DMN7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Amd1P0DMN7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Amd1P0DMN7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Amd1P0DMN7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Amd1P0DMN7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Amd1P0DMN7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Amd1P0DMN7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Amd1P0DMN7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Amd1P0DMN7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Amd1P0DMN7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Amd1P0DMN7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Amd1P0DMN7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Amd1P0DMN7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Amd1P0DMN7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Amd1P0DMN7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Amd1P0DMN7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Amd1P0DMN7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Amd1P0DMN7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Amd1P0DMN7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Amd1P0DMN7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Amd1P0DMN7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Amd1P0DMN7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Amd1P0DMN7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Amd1P0DMN7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Amd1P0DMN7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Amd1P0DMN7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Amd1P0DMN7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Amd1P0DMN7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Amd1P0DMN7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Amd1P0DMN7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Amd1P0DMN7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Amd1P0DMN7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms