Protein–RNA interactions for Protein: P0C7N9

Psmg4, Proteasome assembly chaperone 4, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg4P0C7N9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmg4P0C7N9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmg4P0C7N9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmg4P0C7N9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmg4P0C7N9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Psmg4P0C7N9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmg4P0C7N9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmg4P0C7N9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmg4P0C7N9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmg4P0C7N9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmg4P0C7N9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmg4P0C7N9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmg4P0C7N9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmg4P0C7N9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmg4P0C7N9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmg4P0C7N9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmg4P0C7N9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmg4P0C7N9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmg4P0C7N9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmg4P0C7N9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmg4P0C7N9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmg4P0C7N9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmg4P0C7N9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmg4P0C7N9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmg4P0C7N9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmg4P0C7N9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmg4P0C7N9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmg4P0C7N9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmg4P0C7N9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmg4P0C7N9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmg4P0C7N9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmg4P0C7N9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmg4P0C7N9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmg4P0C7N9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmg4P0C7N9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmg4P0C7N9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psmg4P0C7N9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmg4P0C7N9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms