Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P06336 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P06336 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
P06336 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P06336 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P06336 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P06336 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P06336 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P06336 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P06336 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P06336 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P06336 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P06336 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P06336 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P06336 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P06336 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P06336 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P06336 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P06336 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P06336 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
P06336 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
P06336 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P06336 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P06336 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P06336 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P06336 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P06336 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P06336 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P06336 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P06336 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P06336 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P06336 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P06336 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P06336 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P06336 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P06336 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P06336 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P06336 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P06336 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
P06336 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P06336 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P06336 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P06336 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P06336 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P06336 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P06336 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P06336 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P06336 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P06336 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
P06336 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P06336 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P06336 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P06336 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
P06336 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P06336 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
P06336 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P06336 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
P06336 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P06336 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P06336 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P06336 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P06336 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P06336 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P06336 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
P06336 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
P06336 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P06336 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P06336 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
P06336 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P06336 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P06336 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P06336 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P06336 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P06336 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P06336 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P06336 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P06336 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P06336 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P06336 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P06336 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P06336 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P06336 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P06336 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P06336 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P06336 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P06336 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P06336 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P06336 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P06336 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P06336 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P06336 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P06336 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
P06336 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P06336 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P06336 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P06336 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P06336 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P06336 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P06336 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P06336 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms