Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdgfrbP05622 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdgfrbP05622 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdgfrbP05622 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdgfrbP05622 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdgfrbP05622 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PdgfrbP05622 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PdgfrbP05622 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PdgfrbP05622 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PdgfrbP05622 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PdgfrbP05622 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PdgfrbP05622 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PdgfrbP05622 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfrbP05622 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfrbP05622 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfrbP05622 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PdgfrbP05622 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PdgfrbP05622 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PdgfrbP05622 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PdgfrbP05622 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PdgfrbP05622 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdgfrbP05622 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdgfrbP05622 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdgfrbP05622 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdgfrbP05622 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PdgfrbP05622 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PdgfrbP05622 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PdgfrbP05622 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PdgfrbP05622 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdgfrbP05622 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdgfrbP05622 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdgfrbP05622 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdgfrbP05622 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdgfrbP05622 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdgfrbP05622 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PdgfrbP05622 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PdgfrbP05622 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PdgfrbP05622 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PdgfrbP05622 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PdgfrbP05622 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PdgfrbP05622 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PdgfrbP05622 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PdgfrbP05622 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PdgfrbP05622 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PdgfrbP05622 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PdgfrbP05622 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PdgfrbP05622 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PdgfrbP05622 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PdgfrbP05622 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PdgfrbP05622 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PdgfrbP05622 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PdgfrbP05622 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PdgfrbP05622 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PdgfrbP05622 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PdgfrbP05622 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PdgfrbP05622 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PdgfrbP05622 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PdgfrbP05622 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PdgfrbP05622 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PdgfrbP05622 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PdgfrbP05622 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PdgfrbP05622 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PdgfrbP05622 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PdgfrbP05622 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PdgfrbP05622 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PdgfrbP05622 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PdgfrbP05622 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PdgfrbP05622 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PdgfrbP05622 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PdgfrbP05622 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PdgfrbP05622 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PdgfrbP05622 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PdgfrbP05622 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdgfrbP05622 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdgfrbP05622 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PdgfrbP05622 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdgfrbP05622 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PdgfrbP05622 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PdgfrbP05622 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PdgfrbP05622 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PdgfrbP05622 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PdgfrbP05622 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PdgfrbP05622 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PdgfrbP05622 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PdgfrbP05622 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PdgfrbP05622 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PdgfrbP05622 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PdgfrbP05622 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PdgfrbP05622 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PdgfrbP05622 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PdgfrbP05622 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PdgfrbP05622 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PdgfrbP05622 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PdgfrbP05622 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfrbP05622 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfrbP05622 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfrbP05622 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfrbP05622 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfrbP05622 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfrbP05622 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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