Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt1P04104 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt1P04104 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt1P04104 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt1P04104 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt1P04104 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt1P04104 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt1P04104 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt1P04104 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt1P04104 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt1P04104 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt1P04104 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt1P04104 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt1P04104 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt1P04104 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt1P04104 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt1P04104 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt1P04104 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt1P04104 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt1P04104 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt1P04104 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt1P04104 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt1P04104 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
Krt1P04104 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt1P04104 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt1P04104 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt1P04104 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt1P04104 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt1P04104 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt1P04104 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt1P04104 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt1P04104 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt1P04104 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt1P04104 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt1P04104 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt1P04104 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt1P04104 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt1P04104 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt1P04104 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt1P04104 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt1P04104 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt1P04104 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt1P04104 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt1P04104 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt1P04104 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt1P04104 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt1P04104 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt1P04104 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt1P04104 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt1P04104 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt1P04104 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt1P04104 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt1P04104 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt1P04104 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt1P04104 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt1P04104 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt1P04104 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt1P04104 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt1P04104 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt1P04104 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt1P04104 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt1P04104 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt1P04104 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt1P04104 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt1P04104 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt1P04104 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt1P04104 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt1P04104 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt1P04104 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt1P04104 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt1P04104 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt1P04104 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt1P04104 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt1P04104 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt1P04104 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt1P04104 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt1P04104 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt1P04104 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt1P04104 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt1P04104 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms