Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Hoxa7P02830 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Hoxa7P02830 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Hoxa7P02830 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Hoxa7P02830 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Hoxa7P02830 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Hoxa7P02830 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Hoxa7P02830 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Hoxa7P02830 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Hoxa7P02830 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Hoxa7P02830 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Hoxa7P02830 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Hoxa7P02830 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Hoxa7P02830 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Hoxa7P02830 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Hoxa7P02830 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Hoxa7P02830 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Hoxa7P02830 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Hoxa7P02830 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Hoxa7P02830 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Hoxa7P02830 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Hoxa7P02830 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Hoxa7P02830 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
Hoxa7P02830 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Hoxa7P02830 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Hoxa7P02830 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Hoxa7P02830 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Hoxa7P02830 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Hoxa7P02830 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Hoxa7P02830 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Hoxa7P02830 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Hoxa7P02830 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30,2■■■□□ 2,43
Hoxa7P02830 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,42
Hoxa7P02830 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Hoxa7P02830 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Hoxa7P02830 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Hoxa7P02830 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Hoxa7P02830 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Hoxa7P02830 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Hoxa7P02830 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,16■■■□□ 2,42
Hoxa7P02830 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Hoxa7P02830 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Hoxa7P02830 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Hoxa7P02830 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Hoxa7P02830 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Hoxa7P02830 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Hoxa7P02830 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Hoxa7P02830 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30,09■■■□□ 2,41
Hoxa7P02830 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,09■■■□□ 2,41
Hoxa7P02830 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Hoxa7P02830 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Hoxa7P02830 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Hoxa7P02830 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Hoxa7P02830 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Hoxa7P02830 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Hoxa7P02830 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30,05■■■□□ 2,4
Hoxa7P02830 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Hoxa7P02830 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Hoxa7P02830 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Hoxa7P02830 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Hoxa7P02830 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Hoxa7P02830 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Hoxa7P02830 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Hoxa7P02830 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Hoxa7P02830 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Hoxa7P02830 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Hoxa7P02830 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Hoxa7P02830 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Hoxa7P02830 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Hoxa7P02830 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Hoxa7P02830 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Hoxa7P02830 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Hoxa7P02830 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Hoxa7P02830 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Hoxa7P02830 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Hoxa7P02830 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
Hoxa7P02830 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Hoxa7P02830 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Hoxa7P02830 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29,92■■■□□ 2,38
Hoxa7P02830 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Hoxa7P02830 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Hoxa7P02830 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Hoxa7P02830 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Hoxa7P02830 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Hoxa7P02830 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Hoxa7P02830 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Hoxa7P02830 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Hoxa7P02830 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Hoxa7P02830 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Hoxa7P02830 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Hoxa7P02830 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Hoxa7P02830 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Hoxa7P02830 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
Hoxa7P02830 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Hoxa7P02830 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Hoxa7P02830 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Hoxa7P02830 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Hoxa7P02830 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Hoxa7P02830 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Hoxa7P02830 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms