Protein–RNA interactions for Protein: P01793

Ig heavy chain V region HPCG13, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01793 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01793 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01793 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01793 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01793 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01793 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01793 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01793 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01793 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01793 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01793 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01793 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01793 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01793 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01793 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01793 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01793 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01793 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01793 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01793 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01793 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01793 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01793 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01793 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01793 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01793 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01793 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01793 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01793 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01793 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P01793 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01793 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01793 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01793 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01793 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01793 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01793 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01793 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01793 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01793 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01793 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01793 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01793 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01793 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01793 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01793 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01793 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01793 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01793 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01793 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01793 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01793 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01793 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01793 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01793 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01793 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01793 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01793 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01793 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01793 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01793 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
P01793 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01793 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01793 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01793 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01793 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01793 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01793 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01793 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01793 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01793 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01793 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01793 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01793 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01793 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01793 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01793 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01793 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01793 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01793 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01793 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01793 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01793 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01793 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01793 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01793 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01793 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01793 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01793 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01793 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01793 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01793 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01793 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01793 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01793 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01793 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01793 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01793 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01793 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01793 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms