Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01755 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01755 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01755 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01755 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01755 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01755 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01755 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01755 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01755 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01755 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01755 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01755 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01755 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01755 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01755 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01755 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
P01755 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01755 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01755 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01755 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01755 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01755 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01755 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01755 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01755 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01755 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01755 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01755 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01755 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01755 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01755 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01755 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01755 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01755 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01755 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01755 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01755 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01755 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01755 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01755 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01755 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01755 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01755 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01755 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01755 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01755 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01755 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01755 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01755 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01755 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01755 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01755 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01755 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01755 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01755 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01755 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01755 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01755 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01755 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01755 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01755 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01755 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01755 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01755 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01755 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01755 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01755 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01755 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01755 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01755 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01755 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01755 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01755 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01755 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01755 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01755 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01755 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01755 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01755 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01755 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01755 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01755 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01755 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01755 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01755 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01755 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01755 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01755 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01755 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01755 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01755 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01755 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01755 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01755 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01755 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01755 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01755 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01755 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01755 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms