Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
P01673 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
P01673 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
P01673 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
P01673 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
P01673 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
P01673 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P01673 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P01673 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
P01673 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
P01673 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
P01673 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
P01673 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
P01673 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
P01673 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
P01673 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
P01673 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
P01673 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01673 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01673 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01673 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01673 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01673 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
P01673 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01673 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01673 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01673 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
P01673 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P01673 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P01673 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
P01673 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
P01673 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01673 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01673 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01673 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01673 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01673 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01673 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01673 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01673 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01673 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01673 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P01673 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P01673 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P01673 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P01673 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P01673 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
P01673 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P01673 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P01673 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
P01673 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
P01673 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P01673 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P01673 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
P01673 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
P01673 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P01673 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P01673 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01673 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01673 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01673 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01673 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01673 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P01673 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P01673 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
P01673 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01673 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01673 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01673 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01673 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P01673 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P01673 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
P01673 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P01673 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P01673 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
P01673 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P01673 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P01673 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P01673 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P01673 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P01673 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P01673 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P01673 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P01673 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01673 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
P01673 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01673 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P01673 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
P01673 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P01673 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P01673 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P01673 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P01673 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P01673 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P01673 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P01673 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P01673 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01673 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01673 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01673 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms