Protein–RNA interactions for Protein: O88829

St3gal5, Lactosylceramide alpha-2,3-sialyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
St3gal5O88829 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
St3gal5O88829 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
St3gal5O88829 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
St3gal5O88829 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
St3gal5O88829 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
St3gal5O88829 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
St3gal5O88829 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
St3gal5O88829 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
St3gal5O88829 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
St3gal5O88829 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
St3gal5O88829 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
St3gal5O88829 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
St3gal5O88829 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
St3gal5O88829 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
St3gal5O88829 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
St3gal5O88829 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
St3gal5O88829 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
St3gal5O88829 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
St3gal5O88829 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
St3gal5O88829 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
St3gal5O88829 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
St3gal5O88829 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
St3gal5O88829 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
St3gal5O88829 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
St3gal5O88829 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
St3gal5O88829 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
St3gal5O88829 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
St3gal5O88829 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
St3gal5O88829 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
St3gal5O88829 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
St3gal5O88829 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
St3gal5O88829 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
St3gal5O88829 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
St3gal5O88829 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
St3gal5O88829 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
St3gal5O88829 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
St3gal5O88829 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
St3gal5O88829 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
St3gal5O88829 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
St3gal5O88829 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
St3gal5O88829 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
St3gal5O88829 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
St3gal5O88829 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
St3gal5O88829 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
St3gal5O88829 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
St3gal5O88829 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
St3gal5O88829 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
St3gal5O88829 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
St3gal5O88829 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
St3gal5O88829 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
St3gal5O88829 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
St3gal5O88829 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
St3gal5O88829 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
St3gal5O88829 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
St3gal5O88829 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
St3gal5O88829 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
St3gal5O88829 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
St3gal5O88829 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
St3gal5O88829 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
St3gal5O88829 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
St3gal5O88829 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
St3gal5O88829 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
St3gal5O88829 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
St3gal5O88829 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
St3gal5O88829 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
St3gal5O88829 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
St3gal5O88829 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
St3gal5O88829 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
St3gal5O88829 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
St3gal5O88829 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
St3gal5O88829 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
St3gal5O88829 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
St3gal5O88829 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
St3gal5O88829 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
St3gal5O88829 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
St3gal5O88829 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
St3gal5O88829 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
St3gal5O88829 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
St3gal5O88829 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
St3gal5O88829 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
St3gal5O88829 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
St3gal5O88829 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
St3gal5O88829 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
St3gal5O88829 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
St3gal5O88829 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
St3gal5O88829 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
St3gal5O88829 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
St3gal5O88829 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
St3gal5O88829 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
St3gal5O88829 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
St3gal5O88829 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
St3gal5O88829 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
St3gal5O88829 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
St3gal5O88829 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
St3gal5O88829 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
St3gal5O88829 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
St3gal5O88829 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
St3gal5O88829 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
St3gal5O88829 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
St3gal5O88829 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms