Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dync1i1O88485 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dync1i1O88485 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dync1i1O88485 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dync1i1O88485 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dync1i1O88485 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dync1i1O88485 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dync1i1O88485 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dync1i1O88485 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dync1i1O88485 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dync1i1O88485 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dync1i1O88485 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dync1i1O88485 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dync1i1O88485 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dync1i1O88485 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Dync1i1O88485 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dync1i1O88485 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dync1i1O88485 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dync1i1O88485 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dync1i1O88485 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dync1i1O88485 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Dync1i1O88485 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dync1i1O88485 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dync1i1O88485 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dync1i1O88485 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dync1i1O88485 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dync1i1O88485 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dync1i1O88485 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dync1i1O88485 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dync1i1O88485 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dync1i1O88485 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dync1i1O88485 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dync1i1O88485 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dync1i1O88485 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dync1i1O88485 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dync1i1O88485 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dync1i1O88485 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dync1i1O88485 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dync1i1O88485 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dync1i1O88485 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Dync1i1O88485 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dync1i1O88485 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dync1i1O88485 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dync1i1O88485 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dync1i1O88485 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dync1i1O88485 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dync1i1O88485 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dync1i1O88485 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dync1i1O88485 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dync1i1O88485 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dync1i1O88485 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dync1i1O88485 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dync1i1O88485 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dync1i1O88485 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dync1i1O88485 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dync1i1O88485 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dync1i1O88485 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dync1i1O88485 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dync1i1O88485 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dync1i1O88485 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dync1i1O88485 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dync1i1O88485 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dync1i1O88485 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dync1i1O88485 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dync1i1O88485 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dync1i1O88485 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dync1i1O88485 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dync1i1O88485 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Dync1i1O88485 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dync1i1O88485 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dync1i1O88485 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dync1i1O88485 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dync1i1O88485 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dync1i1O88485 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dync1i1O88485 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dync1i1O88485 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dync1i1O88485 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Dync1i1O88485 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dync1i1O88485 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dync1i1O88485 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dync1i1O88485 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dync1i1O88485 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Dync1i1O88485 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dync1i1O88485 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dync1i1O88485 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Dync1i1O88485 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dync1i1O88485 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dync1i1O88485 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dync1i1O88485 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dync1i1O88485 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dync1i1O88485 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dync1i1O88485 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dync1i1O88485 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dync1i1O88485 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Dync1i1O88485 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dync1i1O88485 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dync1i1O88485 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dync1i1O88485 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dync1i1O88485 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dync1i1O88485 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms