Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AvilO88398 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AvilO88398 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AvilO88398 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AvilO88398 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AvilO88398 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
AvilO88398 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AvilO88398 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AvilO88398 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AvilO88398 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AvilO88398 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AvilO88398 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AvilO88398 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AvilO88398 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AvilO88398 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AvilO88398 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AvilO88398 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AvilO88398 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AvilO88398 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AvilO88398 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AvilO88398 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AvilO88398 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AvilO88398 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AvilO88398 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AvilO88398 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AvilO88398 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AvilO88398 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AvilO88398 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AvilO88398 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AvilO88398 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AvilO88398 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AvilO88398 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AvilO88398 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AvilO88398 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AvilO88398 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AvilO88398 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AvilO88398 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AvilO88398 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AvilO88398 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AvilO88398 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AvilO88398 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AvilO88398 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AvilO88398 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AvilO88398 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AvilO88398 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AvilO88398 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AvilO88398 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AvilO88398 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AvilO88398 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AvilO88398 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AvilO88398 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AvilO88398 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AvilO88398 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AvilO88398 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AvilO88398 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AvilO88398 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AvilO88398 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AvilO88398 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AvilO88398 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AvilO88398 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AvilO88398 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AvilO88398 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AvilO88398 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AvilO88398 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
AvilO88398 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AvilO88398 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AvilO88398 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AvilO88398 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AvilO88398 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AvilO88398 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AvilO88398 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AvilO88398 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AvilO88398 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
AvilO88398 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AvilO88398 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AvilO88398 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AvilO88398 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AvilO88398 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AvilO88398 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AvilO88398 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AvilO88398 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AvilO88398 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AvilO88398 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AvilO88398 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AvilO88398 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AvilO88398 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AvilO88398 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AvilO88398 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AvilO88398 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AvilO88398 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AvilO88398 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AvilO88398 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AvilO88398 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AvilO88398 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AvilO88398 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AvilO88398 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AvilO88398 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AvilO88398 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AvilO88398 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AvilO88398 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms