Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctnnal1O88327 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ctnnal1O88327 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctnnal1O88327 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctnnal1O88327 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctnnal1O88327 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnnal1O88327 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnnal1O88327 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnnal1O88327 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnnal1O88327 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctnnal1O88327 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctnnal1O88327 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctnnal1O88327 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctnnal1O88327 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ctnnal1O88327 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ctnnal1O88327 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctnnal1O88327 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctnnal1O88327 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctnnal1O88327 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctnnal1O88327 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctnnal1O88327 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctnnal1O88327 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctnnal1O88327 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctnnal1O88327 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ctnnal1O88327 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ctnnal1O88327 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ctnnal1O88327 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ctnnal1O88327 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnnal1O88327 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctnnal1O88327 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctnnal1O88327 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctnnal1O88327 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctnnal1O88327 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnnal1O88327 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnnal1O88327 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnnal1O88327 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ctnnal1O88327 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ctnnal1O88327 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ctnnal1O88327 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ctnnal1O88327 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ctnnal1O88327 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ctnnal1O88327 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ctnnal1O88327 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ctnnal1O88327 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnnal1O88327 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnnal1O88327 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnnal1O88327 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ctnnal1O88327 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctnnal1O88327 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ctnnal1O88327 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctnnal1O88327 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctnnal1O88327 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctnnal1O88327 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctnnal1O88327 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnnal1O88327 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnnal1O88327 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnnal1O88327 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctnnal1O88327 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctnnal1O88327 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctnnal1O88327 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctnnal1O88327 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctnnal1O88327 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctnnal1O88327 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctnnal1O88327 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctnnal1O88327 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctnnal1O88327 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctnnal1O88327 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctnnal1O88327 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctnnal1O88327 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctnnal1O88327 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctnnal1O88327 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctnnal1O88327 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctnnal1O88327 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctnnal1O88327 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctnnal1O88327 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctnnal1O88327 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctnnal1O88327 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctnnal1O88327 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctnnal1O88327 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctnnal1O88327 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctnnal1O88327 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms