Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srpk1O70551 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Srpk1O70551 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srpk1O70551 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srpk1O70551 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srpk1O70551 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srpk1O70551 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srpk1O70551 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srpk1O70551 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srpk1O70551 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srpk1O70551 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srpk1O70551 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srpk1O70551 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srpk1O70551 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srpk1O70551 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srpk1O70551 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Srpk1O70551 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srpk1O70551 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srpk1O70551 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srpk1O70551 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srpk1O70551 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srpk1O70551 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srpk1O70551 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srpk1O70551 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Srpk1O70551 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srpk1O70551 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srpk1O70551 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srpk1O70551 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srpk1O70551 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srpk1O70551 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Srpk1O70551 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Srpk1O70551 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Srpk1O70551 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Srpk1O70551 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srpk1O70551 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srpk1O70551 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srpk1O70551 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srpk1O70551 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srpk1O70551 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srpk1O70551 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srpk1O70551 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srpk1O70551 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srpk1O70551 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srpk1O70551 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srpk1O70551 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Srpk1O70551 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srpk1O70551 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srpk1O70551 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Srpk1O70551 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srpk1O70551 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srpk1O70551 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srpk1O70551 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Srpk1O70551 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srpk1O70551 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srpk1O70551 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Srpk1O70551 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srpk1O70551 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srpk1O70551 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srpk1O70551 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srpk1O70551 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srpk1O70551 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srpk1O70551 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Srpk1O70551 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Srpk1O70551 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srpk1O70551 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srpk1O70551 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Srpk1O70551 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Srpk1O70551 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Srpk1O70551 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srpk1O70551 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srpk1O70551 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srpk1O70551 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Srpk1O70551 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Srpk1O70551 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Srpk1O70551 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms