Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx12O70493 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx12O70493 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx12O70493 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snx12O70493 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snx12O70493 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snx12O70493 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Snx12O70493 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Snx12O70493 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Snx12O70493 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Snx12O70493 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Snx12O70493 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snx12O70493 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snx12O70493 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx12O70493 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx12O70493 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx12O70493 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Snx12O70493 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snx12O70493 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snx12O70493 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Snx12O70493 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snx12O70493 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx12O70493 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx12O70493 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx12O70493 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Snx12O70493 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snx12O70493 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx12O70493 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx12O70493 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx12O70493 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx12O70493 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx12O70493 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx12O70493 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snx12O70493 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx12O70493 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx12O70493 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snx12O70493 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snx12O70493 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx12O70493 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx12O70493 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snx12O70493 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snx12O70493 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx12O70493 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx12O70493 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx12O70493 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx12O70493 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx12O70493 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx12O70493 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx12O70493 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx12O70493 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx12O70493 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx12O70493 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx12O70493 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx12O70493 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx12O70493 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx12O70493 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx12O70493 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx12O70493 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snx12O70493 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snx12O70493 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx12O70493 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx12O70493 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx12O70493 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx12O70493 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx12O70493 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx12O70493 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx12O70493 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx12O70493 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snx12O70493 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snx12O70493 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snx12O70493 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Snx12O70493 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Snx12O70493 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx12O70493 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx12O70493 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx12O70493 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx12O70493 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx12O70493 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Snx12O70493 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snx12O70493 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx12O70493 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx12O70493 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snx12O70493 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snx12O70493 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx12O70493 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx12O70493 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx12O70493 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx12O70493 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx12O70493 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx12O70493 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx12O70493 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx12O70493 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx12O70493 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx12O70493 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx12O70493 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx12O70493 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx12O70493 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx12O70493 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx12O70493 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx12O70493 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms