Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Psma3O70435 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Psma3O70435 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Psma3O70435 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Psma3O70435 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Psma3O70435 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Psma3O70435 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Psma3O70435 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Psma3O70435 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Psma3O70435 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Psma3O70435 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Psma3O70435 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Psma3O70435 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Psma3O70435 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Psma3O70435 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
Psma3O70435 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Psma3O70435 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Psma3O70435 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
Psma3O70435 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Psma3O70435 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Psma3O70435 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,2■■□□□ 1,63
Psma3O70435 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Psma3O70435 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Psma3O70435 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Psma3O70435 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Psma3O70435 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Psma3O70435 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Psma3O70435 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
Psma3O70435 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Psma3O70435 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Psma3O70435 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Psma3O70435 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Psma3O70435 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25,14■■□□□ 1,62
Psma3O70435 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Psma3O70435 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Psma3O70435 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Psma3O70435 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Psma3O70435 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Psma3O70435 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Psma3O70435 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Psma3O70435 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Psma3O70435 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25,08■■□□□ 1,6
Psma3O70435 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Psma3O70435 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Psma3O70435 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Psma3O70435 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Psma3O70435 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Psma3O70435 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Psma3O70435 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Psma3O70435 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Psma3O70435 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Psma3O70435 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Psma3O70435 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Psma3O70435 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Psma3O70435 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
Psma3O70435 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Psma3O70435 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Psma3O70435 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Psma3O70435 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Psma3O70435 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Psma3O70435 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Psma3O70435 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Psma3O70435 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24,99■■□□□ 1,59
Psma3O70435 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Psma3O70435 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Psma3O70435 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Psma3O70435 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Psma3O70435 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24,96■■□□□ 1,59
Psma3O70435 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
Psma3O70435 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Psma3O70435 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Psma3O70435 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Psma3O70435 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Psma3O70435 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Psma3O70435 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Psma3O70435 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Psma3O70435 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Psma3O70435 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Psma3O70435 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Psma3O70435 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24,9■■□□□ 1,58
Psma3O70435 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24,9■■□□□ 1,58
Psma3O70435 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Psma3O70435 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Psma3O70435 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Psma3O70435 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Psma3O70435 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Psma3O70435 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Psma3O70435 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Psma3O70435 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24,87■■□□□ 1,57
Psma3O70435 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Psma3O70435 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Psma3O70435 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Psma3O70435 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Psma3O70435 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Psma3O70435 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Psma3O70435 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Psma3O70435 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Psma3O70435 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Psma3O70435 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Psma3O70435 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43,4 ms