Protein–RNA interactions for Protein: O70338

Rnaseh1, Ribonuclease H1, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh1O70338 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnaseh1O70338 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnaseh1O70338 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rnaseh1O70338 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnaseh1O70338 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Rnaseh1O70338 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Rnaseh1O70338 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rnaseh1O70338 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnaseh1O70338 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnaseh1O70338 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnaseh1O70338 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rnaseh1O70338 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rnaseh1O70338 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnaseh1O70338 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnaseh1O70338 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnaseh1O70338 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnaseh1O70338 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnaseh1O70338 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnaseh1O70338 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnaseh1O70338 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnaseh1O70338 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnaseh1O70338 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnaseh1O70338 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnaseh1O70338 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnaseh1O70338 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnaseh1O70338 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnaseh1O70338 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnaseh1O70338 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnaseh1O70338 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnaseh1O70338 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnaseh1O70338 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnaseh1O70338 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnaseh1O70338 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rnaseh1O70338 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnaseh1O70338 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnaseh1O70338 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnaseh1O70338 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnaseh1O70338 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnaseh1O70338 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnaseh1O70338 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnaseh1O70338 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnaseh1O70338 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnaseh1O70338 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rnaseh1O70338 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnaseh1O70338 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnaseh1O70338 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnaseh1O70338 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnaseh1O70338 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnaseh1O70338 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnaseh1O70338 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnaseh1O70338 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnaseh1O70338 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnaseh1O70338 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnaseh1O70338 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnaseh1O70338 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnaseh1O70338 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnaseh1O70338 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnaseh1O70338 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnaseh1O70338 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnaseh1O70338 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rnaseh1O70338 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnaseh1O70338 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnaseh1O70338 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnaseh1O70338 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnaseh1O70338 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnaseh1O70338 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnaseh1O70338 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnaseh1O70338 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnaseh1O70338 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnaseh1O70338 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnaseh1O70338 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rnaseh1O70338 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rnaseh1O70338 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnaseh1O70338 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnaseh1O70338 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnaseh1O70338 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnaseh1O70338 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnaseh1O70338 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnaseh1O70338 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnaseh1O70338 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnaseh1O70338 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnaseh1O70338 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnaseh1O70338 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnaseh1O70338 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnaseh1O70338 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnaseh1O70338 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnaseh1O70338 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnaseh1O70338 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnaseh1O70338 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnaseh1O70338 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnaseh1O70338 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnaseh1O70338 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnaseh1O70338 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnaseh1O70338 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnaseh1O70338 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnaseh1O70338 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnaseh1O70338 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnaseh1O70338 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnaseh1O70338 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnaseh1O70338 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms