Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alx3O70137 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alx3O70137 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alx3O70137 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alx3O70137 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alx3O70137 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alx3O70137 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alx3O70137 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Alx3O70137 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alx3O70137 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx3O70137 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx3O70137 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alx3O70137 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alx3O70137 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alx3O70137 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alx3O70137 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alx3O70137 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alx3O70137 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alx3O70137 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alx3O70137 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alx3O70137 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alx3O70137 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alx3O70137 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alx3O70137 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alx3O70137 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alx3O70137 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alx3O70137 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alx3O70137 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alx3O70137 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alx3O70137 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alx3O70137 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alx3O70137 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alx3O70137 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alx3O70137 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alx3O70137 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alx3O70137 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alx3O70137 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alx3O70137 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alx3O70137 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alx3O70137 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx3O70137 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Alx3O70137 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alx3O70137 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx3O70137 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alx3O70137 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alx3O70137 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alx3O70137 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx3O70137 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx3O70137 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx3O70137 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx3O70137 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alx3O70137 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alx3O70137 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alx3O70137 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alx3O70137 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alx3O70137 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alx3O70137 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alx3O70137 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Alx3O70137 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alx3O70137 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx3O70137 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx3O70137 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx3O70137 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx3O70137 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx3O70137 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alx3O70137 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alx3O70137 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alx3O70137 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alx3O70137 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alx3O70137 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Alx3O70137 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Alx3O70137 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alx3O70137 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Alx3O70137 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Alx3O70137 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Alx3O70137 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Alx3O70137 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Alx3O70137 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Alx3O70137 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Alx3O70137 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Alx3O70137 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms