Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl35aO55142 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl35aO55142 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl35aO55142 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl35aO55142 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl35aO55142 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl35aO55142 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl35aO55142 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl35aO55142 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl35aO55142 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl35aO55142 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl35aO55142 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl35aO55142 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl35aO55142 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl35aO55142 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl35aO55142 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl35aO55142 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl35aO55142 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl35aO55142 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl35aO55142 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl35aO55142 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl35aO55142 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl35aO55142 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl35aO55142 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl35aO55142 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl35aO55142 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl35aO55142 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl35aO55142 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl35aO55142 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl35aO55142 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl35aO55142 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl35aO55142 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl35aO55142 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl35aO55142 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl35aO55142 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl35aO55142 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl35aO55142 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl35aO55142 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl35aO55142 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl35aO55142 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl35aO55142 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl35aO55142 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl35aO55142 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35aO55142 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl35aO55142 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl35aO55142 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl35aO55142 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms