Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SlkO54988 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SlkO54988 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SlkO54988 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SlkO54988 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SlkO54988 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SlkO54988 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SlkO54988 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SlkO54988 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SlkO54988 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SlkO54988 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SlkO54988 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SlkO54988 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SlkO54988 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SlkO54988 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SlkO54988 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SlkO54988 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SlkO54988 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SlkO54988 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SlkO54988 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SlkO54988 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SlkO54988 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SlkO54988 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SlkO54988 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SlkO54988 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SlkO54988 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SlkO54988 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SlkO54988 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SlkO54988 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SlkO54988 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SlkO54988 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SlkO54988 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SlkO54988 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SlkO54988 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SlkO54988 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SlkO54988 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SlkO54988 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SlkO54988 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SlkO54988 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SlkO54988 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SlkO54988 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SlkO54988 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SlkO54988 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SlkO54988 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SlkO54988 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SlkO54988 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SlkO54988 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SlkO54988 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SlkO54988 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SlkO54988 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SlkO54988 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SlkO54988 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SlkO54988 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SlkO54988 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SlkO54988 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SlkO54988 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SlkO54988 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SlkO54988 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SlkO54988 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SlkO54988 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SlkO54988 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SlkO54988 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SlkO54988 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SlkO54988 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SlkO54988 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SlkO54988 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SlkO54988 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SlkO54988 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SlkO54988 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SlkO54988 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SlkO54988 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SlkO54988 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SlkO54988 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SlkO54988 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SlkO54988 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SlkO54988 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SlkO54988 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SlkO54988 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SlkO54988 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SlkO54988 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SlkO54988 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SlkO54988 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SlkO54988 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SlkO54988 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SlkO54988 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SlkO54988 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SlkO54988 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SlkO54988 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SlkO54988 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SlkO54988 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SlkO54988 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SlkO54988 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SlkO54988 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SlkO54988 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SlkO54988 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SlkO54988 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SlkO54988 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SlkO54988 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SlkO54988 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SlkO54988 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms