Protein–RNA interactions for Protein: O54931

Akap2, A-kinase anchor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap2O54931 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Akap2O54931 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Akap2O54931 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Akap2O54931 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Akap2O54931 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Akap2O54931 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Akap2O54931 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Akap2O54931 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Akap2O54931 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Akap2O54931 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Akap2O54931 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Akap2O54931 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Akap2O54931 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Akap2O54931 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Akap2O54931 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Akap2O54931 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Akap2O54931 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Akap2O54931 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Akap2O54931 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Akap2O54931 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Akap2O54931 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Akap2O54931 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Akap2O54931 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Akap2O54931 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Akap2O54931 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Akap2O54931 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Akap2O54931 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Akap2O54931 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Akap2O54931 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Akap2O54931 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Akap2O54931 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Akap2O54931 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Akap2O54931 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Akap2O54931 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Akap2O54931 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Akap2O54931 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Akap2O54931 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Akap2O54931 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Akap2O54931 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Akap2O54931 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Akap2O54931 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Akap2O54931 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Akap2O54931 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Akap2O54931 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Akap2O54931 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Akap2O54931 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Akap2O54931 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Akap2O54931 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Akap2O54931 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Akap2O54931 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Akap2O54931 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Akap2O54931 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Akap2O54931 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Akap2O54931 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Akap2O54931 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Akap2O54931 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Akap2O54931 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Akap2O54931 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Akap2O54931 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Akap2O54931 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Akap2O54931 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Akap2O54931 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Akap2O54931 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Akap2O54931 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Akap2O54931 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Akap2O54931 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Akap2O54931 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Akap2O54931 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Akap2O54931 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Akap2O54931 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Akap2O54931 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Akap2O54931 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Akap2O54931 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Akap2O54931 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Akap2O54931 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Akap2O54931 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Akap2O54931 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Akap2O54931 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Akap2O54931 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Akap2O54931 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Akap2O54931 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Akap2O54931 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Akap2O54931 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Akap2O54931 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Akap2O54931 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Akap2O54931 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Akap2O54931 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Akap2O54931 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Akap2O54931 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Akap2O54931 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Akap2O54931 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Akap2O54931 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Akap2O54931 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Akap2O54931 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Akap2O54931 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Akap2O54931 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Akap2O54931 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Akap2O54931 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Akap2O54931 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Akap2O54931 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms