Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csnk2a2O54833 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csnk2a2O54833 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Csnk2a2O54833 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csnk2a2O54833 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csnk2a2O54833 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Csnk2a2O54833 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csnk2a2O54833 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csnk2a2O54833 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csnk2a2O54833 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csnk2a2O54833 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csnk2a2O54833 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csnk2a2O54833 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csnk2a2O54833 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csnk2a2O54833 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Csnk2a2O54833 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csnk2a2O54833 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csnk2a2O54833 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csnk2a2O54833 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csnk2a2O54833 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csnk2a2O54833 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csnk2a2O54833 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csnk2a2O54833 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csnk2a2O54833 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csnk2a2O54833 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csnk2a2O54833 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Csnk2a2O54833 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csnk2a2O54833 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csnk2a2O54833 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csnk2a2O54833 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csnk2a2O54833 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csnk2a2O54833 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csnk2a2O54833 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csnk2a2O54833 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csnk2a2O54833 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csnk2a2O54833 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Csnk2a2O54833 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csnk2a2O54833 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Csnk2a2O54833 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csnk2a2O54833 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csnk2a2O54833 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csnk2a2O54833 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csnk2a2O54833 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Csnk2a2O54833 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csnk2a2O54833 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csnk2a2O54833 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csnk2a2O54833 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csnk2a2O54833 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csnk2a2O54833 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csnk2a2O54833 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csnk2a2O54833 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Csnk2a2O54833 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csnk2a2O54833 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csnk2a2O54833 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csnk2a2O54833 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Csnk2a2O54833 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csnk2a2O54833 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csnk2a2O54833 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csnk2a2O54833 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csnk2a2O54833 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csnk2a2O54833 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Csnk2a2O54833 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csnk2a2O54833 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csnk2a2O54833 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csnk2a2O54833 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csnk2a2O54833 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csnk2a2O54833 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csnk2a2O54833 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Csnk2a2O54833 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms