Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms