Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl25O35903 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl25O35903 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccl25O35903 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl25O35903 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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