Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npc1O35604 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npc1O35604 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npc1O35604 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npc1O35604 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npc1O35604 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npc1O35604 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Npc1O35604 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npc1O35604 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npc1O35604 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npc1O35604 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npc1O35604 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npc1O35604 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npc1O35604 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npc1O35604 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npc1O35604 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npc1O35604 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npc1O35604 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Npc1O35604 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Npc1O35604 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Npc1O35604 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Npc1O35604 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Npc1O35604 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npc1O35604 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npc1O35604 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npc1O35604 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npc1O35604 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npc1O35604 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Npc1O35604 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npc1O35604 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npc1O35604 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Npc1O35604 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npc1O35604 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npc1O35604 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npc1O35604 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Npc1O35604 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npc1O35604 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Npc1O35604 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Npc1O35604 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npc1O35604 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Npc1O35604 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Npc1O35604 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Npc1O35604 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Npc1O35604 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Npc1O35604 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npc1O35604 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npc1O35604 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npc1O35604 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npc1O35604 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npc1O35604 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Npc1O35604 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Npc1O35604 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Npc1O35604 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Npc1O35604 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Npc1O35604 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Npc1O35604 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Npc1O35604 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Npc1O35604 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Npc1O35604 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Npc1O35604 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Npc1O35604 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Npc1O35604 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Npc1O35604 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Npc1O35604 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Npc1O35604 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Npc1O35604 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Npc1O35604 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Npc1O35604 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Npc1O35604 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Npc1O35604 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Npc1O35604 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Npc1O35604 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Npc1O35604 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Npc1O35604 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Npc1O35604 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Npc1O35604 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Npc1O35604 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Npc1O35604 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Npc1O35604 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Npc1O35604 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Npc1O35604 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Npc1O35604 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Npc1O35604 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Npc1O35604 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Npc1O35604 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Npc1O35604 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Npc1O35604 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Npc1O35604 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Npc1O35604 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Npc1O35604 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Npc1O35604 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Npc1O35604 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Npc1O35604 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Npc1O35604 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Npc1O35604 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Npc1O35604 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Npc1O35604 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Npc1O35604 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Npc1O35604 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Npc1O35604 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms