Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TnxbO35452 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TnxbO35452 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TnxbO35452 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TnxbO35452 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TnxbO35452 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TnxbO35452 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TnxbO35452 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TnxbO35452 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TnxbO35452 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TnxbO35452 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TnxbO35452 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TnxbO35452 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TnxbO35452 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TnxbO35452 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TnxbO35452 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TnxbO35452 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TnxbO35452 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TnxbO35452 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TnxbO35452 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TnxbO35452 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TnxbO35452 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnxbO35452 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TnxbO35452 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TnxbO35452 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TnxbO35452 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TnxbO35452 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TnxbO35452 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TnxbO35452 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TnxbO35452 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TnxbO35452 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TnxbO35452 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TnxbO35452 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TnxbO35452 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TnxbO35452 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnxbO35452 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TnxbO35452 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TnxbO35452 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TnxbO35452 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TnxbO35452 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TnxbO35452 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TnxbO35452 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TnxbO35452 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TnxbO35452 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TnxbO35452 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TnxbO35452 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TnxbO35452 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TnxbO35452 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TnxbO35452 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TnxbO35452 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TnxbO35452 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TnxbO35452 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TnxbO35452 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TnxbO35452 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TnxbO35452 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TnxbO35452 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TnxbO35452 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TnxbO35452 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TnxbO35452 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TnxbO35452 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TnxbO35452 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TnxbO35452 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TnxbO35452 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TnxbO35452 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TnxbO35452 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TnxbO35452 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TnxbO35452 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TnxbO35452 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TnxbO35452 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TnxbO35452 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TnxbO35452 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TnxbO35452 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TnxbO35452 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TnxbO35452 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TnxbO35452 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnxbO35452 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnxbO35452 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnxbO35452 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnxbO35452 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnxbO35452 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TnxbO35452 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TnxbO35452 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms