Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RrhO35214 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RrhO35214 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RrhO35214 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RrhO35214 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RrhO35214 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RrhO35214 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RrhO35214 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RrhO35214 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RrhO35214 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RrhO35214 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RrhO35214 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RrhO35214 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RrhO35214 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RrhO35214 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RrhO35214 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RrhO35214 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RrhO35214 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RrhO35214 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RrhO35214 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RrhO35214 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RrhO35214 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RrhO35214 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RrhO35214 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RrhO35214 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RrhO35214 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RrhO35214 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RrhO35214 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RrhO35214 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RrhO35214 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RrhO35214 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RrhO35214 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RrhO35214 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RrhO35214 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RrhO35214 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RrhO35214 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RrhO35214 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RrhO35214 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RrhO35214 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RrhO35214 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RrhO35214 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RrhO35214 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RrhO35214 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RrhO35214 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RrhO35214 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RrhO35214 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RrhO35214 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RrhO35214 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RrhO35214 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RrhO35214 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RrhO35214 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RrhO35214 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RrhO35214 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RrhO35214 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RrhO35214 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RrhO35214 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RrhO35214 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RrhO35214 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RrhO35214 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RrhO35214 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RrhO35214 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RrhO35214 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RrhO35214 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RrhO35214 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RrhO35214 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RrhO35214 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RrhO35214 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RrhO35214 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RrhO35214 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RrhO35214 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RrhO35214 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RrhO35214 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RrhO35214 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RrhO35214 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RrhO35214 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RrhO35214 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RrhO35214 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RrhO35214 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RrhO35214 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RrhO35214 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RrhO35214 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RrhO35214 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RrhO35214 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RrhO35214 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RrhO35214 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RrhO35214 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RrhO35214 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RrhO35214 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RrhO35214 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RrhO35214 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RrhO35214 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RrhO35214 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RrhO35214 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RrhO35214 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RrhO35214 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RrhO35214 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RrhO35214 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RrhO35214 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RrhO35214 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RrhO35214 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms