Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pitx3O35160 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pitx3O35160 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pitx3O35160 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pitx3O35160 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pitx3O35160 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pitx3O35160 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pitx3O35160 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pitx3O35160 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pitx3O35160 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pitx3O35160 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pitx3O35160 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pitx3O35160 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pitx3O35160 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pitx3O35160 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pitx3O35160 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pitx3O35160 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pitx3O35160 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pitx3O35160 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pitx3O35160 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx3O35160 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pitx3O35160 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx3O35160 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx3O35160 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pitx3O35160 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pitx3O35160 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pitx3O35160 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx3O35160 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pitx3O35160 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pitx3O35160 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pitx3O35160 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pitx3O35160 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pitx3O35160 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pitx3O35160 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pitx3O35160 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pitx3O35160 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pitx3O35160 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pitx3O35160 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx3O35160 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx3O35160 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx3O35160 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pitx3O35160 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pitx3O35160 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pitx3O35160 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pitx3O35160 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pitx3O35160 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pitx3O35160 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pitx3O35160 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pitx3O35160 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pitx3O35160 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pitx3O35160 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pitx3O35160 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pitx3O35160 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pitx3O35160 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pitx3O35160 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pitx3O35160 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pitx3O35160 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pitx3O35160 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pitx3O35160 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pitx3O35160 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pitx3O35160 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pitx3O35160 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pitx3O35160 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pitx3O35160 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pitx3O35160 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pitx3O35160 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pitx3O35160 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pitx3O35160 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pitx3O35160 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pitx3O35160 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pitx3O35160 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pitx3O35160 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pitx3O35160 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pitx3O35160 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pitx3O35160 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pitx3O35160 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pitx3O35160 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Pitx3O35160 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pitx3O35160 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pitx3O35160 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms