Protein–RNA interactions for Protein: O35127

Grcc10, Protein C10, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grcc10O35127 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Grcc10O35127 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Grcc10O35127 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Grcc10O35127 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grcc10O35127 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grcc10O35127 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grcc10O35127 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grcc10O35127 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grcc10O35127 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grcc10O35127 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grcc10O35127 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Grcc10O35127 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Grcc10O35127 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grcc10O35127 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grcc10O35127 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grcc10O35127 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grcc10O35127 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grcc10O35127 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grcc10O35127 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grcc10O35127 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grcc10O35127 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grcc10O35127 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grcc10O35127 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grcc10O35127 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grcc10O35127 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grcc10O35127 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grcc10O35127 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grcc10O35127 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grcc10O35127 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grcc10O35127 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grcc10O35127 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grcc10O35127 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grcc10O35127 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grcc10O35127 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grcc10O35127 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grcc10O35127 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grcc10O35127 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grcc10O35127 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grcc10O35127 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grcc10O35127 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grcc10O35127 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grcc10O35127 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grcc10O35127 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grcc10O35127 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grcc10O35127 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grcc10O35127 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grcc10O35127 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grcc10O35127 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grcc10O35127 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grcc10O35127 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grcc10O35127 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grcc10O35127 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grcc10O35127 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grcc10O35127 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grcc10O35127 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grcc10O35127 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms