Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc23O35125 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc23O35125 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc23O35125 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc23O35125 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc23O35125 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc23O35125 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc23O35125 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc23O35125 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc23O35125 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc23O35125 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc23O35125 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc23O35125 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc23O35125 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc23O35125 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc23O35125 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc23O35125 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc23O35125 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc23O35125 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc23O35125 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc23O35125 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc23O35125 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc23O35125 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc23O35125 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc23O35125 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc23O35125 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc23O35125 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc23O35125 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc23O35125 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc23O35125 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc23O35125 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc23O35125 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc23O35125 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc23O35125 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc23O35125 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc23O35125 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc23O35125 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc23O35125 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc23O35125 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc23O35125 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc23O35125 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc23O35125 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc23O35125 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc23O35125 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms