Protein–RNA interactions for Protein: O09105

Neurod4, Neurogenic differentiation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod4O09105 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurod4O09105 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurod4O09105 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurod4O09105 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurod4O09105 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Neurod4O09105 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurod4O09105 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurod4O09105 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurod4O09105 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurod4O09105 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurod4O09105 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurod4O09105 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod4O09105 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod4O09105 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod4O09105 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurod4O09105 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod4O09105 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurod4O09105 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod4O09105 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod4O09105 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod4O09105 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod4O09105 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod4O09105 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod4O09105 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod4O09105 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod4O09105 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod4O09105 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod4O09105 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod4O09105 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurod4O09105 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurod4O09105 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod4O09105 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod4O09105 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod4O09105 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod4O09105 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod4O09105 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod4O09105 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod4O09105 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod4O09105 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod4O09105 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod4O09105 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod4O09105 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod4O09105 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod4O09105 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod4O09105 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod4O09105 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod4O09105 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod4O09105 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod4O09105 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod4O09105 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod4O09105 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod4O09105 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod4O09105 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod4O09105 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod4O09105 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Neurod4O09105 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Neurod4O09105 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Neurod4O09105 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Neurod4O09105 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Neurod4O09105 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Neurod4O09105 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Neurod4O09105 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms