Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eftud2O08810 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eftud2O08810 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Eftud2O08810 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Eftud2O08810 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Eftud2O08810 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Eftud2O08810 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Eftud2O08810 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Eftud2O08810 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Eftud2O08810 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Eftud2O08810 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Eftud2O08810 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Eftud2O08810 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Eftud2O08810 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Eftud2O08810 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Eftud2O08810 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Eftud2O08810 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Eftud2O08810 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Eftud2O08810 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Eftud2O08810 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Eftud2O08810 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Eftud2O08810 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Eftud2O08810 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Eftud2O08810 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Eftud2O08810 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Eftud2O08810 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Eftud2O08810 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Eftud2O08810 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Eftud2O08810 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Eftud2O08810 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Eftud2O08810 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Eftud2O08810 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Eftud2O08810 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Eftud2O08810 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eftud2O08810 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eftud2O08810 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eftud2O08810 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eftud2O08810 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eftud2O08810 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eftud2O08810 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eftud2O08810 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eftud2O08810 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eftud2O08810 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eftud2O08810 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eftud2O08810 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eftud2O08810 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eftud2O08810 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eftud2O08810 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eftud2O08810 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eftud2O08810 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Eftud2O08810 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Eftud2O08810 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Eftud2O08810 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Eftud2O08810 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Eftud2O08810 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Eftud2O08810 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Eftud2O08810 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Eftud2O08810 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Eftud2O08810 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Eftud2O08810 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eftud2O08810 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms