Protein–RNA interactions for Protein: O08709

Prdx6, Peroxiredoxin-6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdx6O08709 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Prdx6O08709 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Prdx6O08709 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Prdx6O08709 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Prdx6O08709 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Prdx6O08709 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21,79■■□□□ 1,08
Prdx6O08709 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Prdx6O08709 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Prdx6O08709 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Prdx6O08709 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Prdx6O08709 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,76■■□□□ 1,07
Prdx6O08709 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21,75■■□□□ 1,07
Prdx6O08709 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Prdx6O08709 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Prdx6O08709 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21,74■■□□□ 1,07
Prdx6O08709 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Prdx6O08709 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Prdx6O08709 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Prdx6O08709 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Prdx6O08709 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Prdx6O08709 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Prdx6O08709 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Prdx6O08709 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21,64■■□□□ 1,05
Prdx6O08709 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Prdx6O08709 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Prdx6O08709 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Prdx6O08709 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Prdx6O08709 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Prdx6O08709 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Prdx6O08709 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Prdx6O08709 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Prdx6O08709 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Prdx6O08709 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Prdx6O08709 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Prdx6O08709 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Prdx6O08709 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Prdx6O08709 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Prdx6O08709 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Prdx6O08709 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Prdx6O08709 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21,58■■□□□ 1,05
Prdx6O08709 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Prdx6O08709 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Prdx6O08709 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Prdx6O08709 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Prdx6O08709 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,55■■□□□ 1,04
Prdx6O08709 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Prdx6O08709 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Prdx6O08709 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Prdx6O08709 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21,53■■□□□ 1,04
Prdx6O08709 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Prdx6O08709 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Prdx6O08709 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Prdx6O08709 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21,52■■□□□ 1,04
Prdx6O08709 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Prdx6O08709 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21,51■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,51■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21,48■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21,48■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,47■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Prdx6O08709 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Prdx6O08709 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Prdx6O08709 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Prdx6O08709 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21,42■■□□□ 1,02
Prdx6O08709 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Prdx6O08709 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,4■■□□□ 1,02
Prdx6O08709 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
Prdx6O08709 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21,39■■□□□ 1,01
Prdx6O08709 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms